Dejiny tejto eparchie sú veľmi zviazané s postavou pápeža Jána XXIII. Ešte ako arcibiskup Angelo Roncalli pôsobil v Bulharsku v rokoch 1925-1934 ako apoštolský nuncius. V roku 1926 vznikol aj vďaka nemu gréckokatolícky exarchát, ktorý fungoval až do jeho povýšenia na eparchiu v roku 2019. Nuncius Roncalli si Bulharsko úprimne obľúbil a známou sa stala jeho dobročinnosť nielen voči katolíkom, ale i voči pravoslávnym. Navyše po svojom odchode z Bulharska neskorší pápež odovzdal svoju rezidenciu pre potreby tamojšieho gréckokatolíckeho exarchátu.