Získanie povolenia na jeho vybudovanie trvalo 25 rokov. Finančné prostriedky pochádzajú od rôznych organizácií, medzi nimi výstavbu podporila aj pápežská nadácia ACN - Pomoc trpiacej Cirkvi.
V kostole je okrem iného obraz Božieho milosrdenstva, ktorému je zasvätené miestne spoločenstvo. Nový kostol v Havane je druhým postaveným na ostrove od roku 1959. Prvý postavili v Sandine na západnom konci ostrova.
Po nástupe k moci Fidel Castro skonfiškoval všetok cirkevný majetok, vyhodil misionárov z krajiny a zaviedol ateizmus. Po páde Berlínskeho múru sa začal pomalý proces otvárania sa Kuby pre vzťahy s Cirkvou a so Svätou stolicou.
Výsledkom bola okrem iného púť Jána Pavla II. na tento ostrov v roku 1998 a potom Benedikta XVI. v roku 2012. Na Kube v Havane sa v roku 2015 uskutočnilo aj slávne stretnutie pápeža Františka s patriarchom Moskvy Cyrilom (Zdroje: RV CZ / Katolícke noviny).